Wbrew panującym przekonaniom okres leczenia jest krótki – w najczęściej obecnie stosowanym protokole antagonistycznym to ok 2,5-3 tyg, w przypadku protokołu długiego ok 6 tyg. Czas ten może ulec wydłużeniu w sytuacjach szczególnych (protokół ultradługi, wielokrotne stymulacje w protokołach progesteronowych).